IBM Summit süper bilgisayarı COVID-19 ile mücadele edecek

Amerika Birleşik Devletleri Enerji Bakanlığı Oak Ridge Ulusal Laboratuvarı (ORNL) içinde, IBM'in Canberra Laboratuvarı'nda kurulduktan sonra, IBM Zirvesi'nin birincil misyonu enerji, ileri malzemeler, insan sağlığı ve yapay zeka alanlarında daha önce uygulanamaz veya imkansız görevleri çözmek.

Araştırmacılara, Zirve'de Big Blue'nun "benzeri görülmemiş hız" olarak adlandırdığı şeyle simülasyon yapmak için acil hesaplama zamanı verildi.

IBM POWER9 destekli sistem kullanılarak, standart bilişim sistemlerinin alacağı aylara göre sonuçlar 1-2 gün içinde görülmüştür.

Bu çalışma sayesinde araştırmacılar, ORNL'nin COVID-19 hastalık salgından sorumlu SARS-CoV-2 koronavirüsüne karşı mücadelede daha fazla çalışma gerektirebileceğini söyleyen 77 küçük moleküllü ilaç bileşiği belirlediler.

Süper bilgisayar, koronavirüsün ana "başak" proteinine bağlanma olasılığı en yüksek olanları taramak için 8.000'den fazla bileşiği simüle ederek konakçı hücreleri enfekte edemedi.

ORNL, fikrin, koronavirüsün bir konakçı hücreye giriş noktasına olan ilgisinden doğduğunu söyledi.

Tennessee Üniversitesi (UT) / ORNL CMB doktora sonrası araştırmacı Micholas Smith, yapının erken çalışmalarına dayanarak S-proteini olarak da adlandırılan bir koronavirüs başak proteini modeli oluşturdu.

Protein içindeki atomların ve parçacıkların hareketlerini analiz eden moleküler dinamik simülasyonları gerçekleştirmek için kimyasal bir simülasyon kodu kullandı.

Smith, koronavirüsün S-protein sivri uçlarına kenetlenen farklı bileşiklerin, herhangi birinin sivriğin insan hücrelerine yapışmasını engelleyip engelleyemeyeceğini belirlemek için simüle etti.

Smith, "Zirve'yi kullanarak, bu bileşikleri S-protein başlangıcına bağlanma olasılıkları ile ilgili bir dizi kritere göre sıraladık." dedi.

"Bizim sonuçlarımız Wuhan koronavirüsü için bir tedavi veya tedavi bulduğumuz anlamına gelmiyor," diye ekledi.

Tennessee Üniversitesi valisi başkanı ve UT / ORNL Moleküler Biyofizik Merkezi direktörü Jeremy Smith

"Ancak, hesaplama bulgularımızın hem gelecekteki çalışmaları bilgilendireceği hem de deneycilerin bu bileşikleri daha fazla araştırmak için kullanacakları bir çerçeve sağlayacağından çok umutluyuz.

Ancak o zaman bunlardan herhangi birinin bu virüsü azaltmak için gerekli özellikleri gösterip göstermediğini bileceğiz."

Summit, araştırmacılara her biri iki IBM POWER9 CPU ve altı Nvidia Tensorcore V100 GPU ile donatılmış 4.608 IBM Power Systems AC922 sunucu düğümü ile sağlanan büyük veri işleme yeteneğini sağladı

Ve 200 petaflop'luk bir tepe performansı sağladı.

Zirve ayrıca evrenin kökenini anlamaya, opioid krizini anlamlandırmaya ve insanların Mars'a nasıl inebileceğini göstermek için de kullanılmıştır.

IBM CEO'su Ginni Rometty, "IBM'in teknik ve endüstri liderlerinden, hükümet ve sağlık kurumlarının salgını izlemesine ve yönetmesine yardımcı olacak tüm seçenekleri değerlendirmelerini istedik." dedi.

Sumet'in savaşta hesaplama gücünü kullanmasının yanı sıra Rometty, IBM'in Watson Health biriminin COVID-19'un doğasını daha iyi anlamak için doğrudan dünyadaki sağlık kuruluşlarıyla birlikte çalıştığını söyledi.

"IBM Klinik Geliştirme sistemi, web etkin cihazlardan veri ve analiz sağlayarak klinik araştırmaların zamanını ve maliyetini azaltmak için ulusal sağlık kurumlarına ücretsiz olarak sunuldu" dedi.

"Ve bilişsel Operasyonel Risk İçgörü aracımız kar amacı gütmeyen kuruluşlar için kullanıma sunuldu."